窦卞先通判汝州。秦悼王被埋葬在汝州，他的很多亲戚都来到汝州，还使用了三千兵士。郡守林潍怕引起-，便以汝州与其家乡较近为借口，使用车辇囤积粮草、并把铁石等防卫器材运到他家。引起了吊丧人群的怨愤，密谋杀林潍，林潍一到晚上就把大门紧闭，秦悼王宗室的人见达不到目的，便带领军营的兵士谋反。窦卞开启大门并诱导他们说：“这些人是喝醉了酒狂呼罢了，不要恐慌。”大家心神才安定下来。窦卞又派精干的兵士悄悄把首恶分子关押起来，请示朝廷如何处理，皇帝下诏让林潍辞去官职，把所有叛乱的人发配流放。
窦卞被任命为集贤校理、知太常院、知绛州、开封府推官。当时刚刚禁止金子买卖，皇城守卒捕获一人，按权限属于窦卞处治，有人来求情。窦卞上奏说：“真宗行此制，是从内宫开始，今不把抓到的人正法，无以示于天，且非0立法本意。”英宗说：“对，文王‘刑于寡妻，至于兄弟，以御于家邦’说的就是这个意思。”同意了窦卞的请求。
窦卞又出知深州。熙宁初年（1068)，滹沱河水决口，淹了许多州县，又发生了大地震。逃难的民众接连不断从恩、冀二州来，窦卞发放了库存粮食救济他们。管理库房的官吏告诉窦卞：擅自分发粮食是要犯罪的。窦卞说：“要想请示完再分发，老百姓早就饿死了。我愿以自己的性命为代价救活数万灾民。”随后，窦卞请示了朝廷。神宗皇帝下诏允许放粮。此时民间讹传洪水将要来，窦卞下令：造谣者斩。一天，又接到报告说大水将至，城吏请闭门，窦卞不同意。后来果然证明是虚报。
有一段时间正征集六州士卒修筑武强县城，有人不服从上级。窦卞说：“士兵和当官的顶嘴，处罚不应当太重，然而鼓动夫役聚众闹事，就不能用平常的处罚了。”于是下令斩首示众。不久皇帝下诏嘉奖了窦卞。任命他为户部判官、-起居注，进天章阁待制，判昭文馆、将作监。
当初，窦卞在汝州为官时，与殿值王永年关系很好，等到了京师，王永年想监金耀门书库，窦卞为此找过杨绘帮忙，杨绘荐举了他。事成之后王永年在家里置办了酒席，邀请杨绘、窦卞，并让妻子陪同饮酒。杨绘、窦卞饮酒兴起，看到王永年妻子用左右手捧起酒一饮而尽，想起了-作的美人诗。诗云：“回眸绿水波初起，合掌白莲花未开。”
王永年因事被关押在监狱至死，御史蔡承禧借机诬告，窦卞受此牵连被免除朝中职务，提举灵仙观。亡故，年仅45岁。