马芳庭,出生于河北赞皇。1929年8月参加革命工作并加入中国共产党。先后担任山西军官教导团中共地下党党委书记,中共太原市委宣传部部长,中共赞皇县工委书记、县委书记,太行冀西、晋冀特委宣传部部长、组织部部长,冀西一分区副司令员兼任赞皇县县长,一二九师政治部民运科副科长,一分区敌后工作站站长,一分区政治部主任、分区副政委兼任地委书记,皖西区党委委员兼六安地委书记、分区政委等职。1950年任皖北区党委委员兼组织部部长,1952年1月任安徽省委组织部副部长兼人事厅厅长,同年12月调纺织工业部任人事司司长。1956年后,先后任部长助理兼任人事司司长、部党委委员、机关党委书记、纺织干部学校校长等职务。1959年3月任北京化工学院党委书记,1960年兼任院长。马芳庭在“文革”中受到破孩,1979年得到平反,复任北京化工学院党委书记兼院长(正部长级医疗待遇),2005年7月14日在北京逝世,享年94岁。
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